Diante da importância da hipertensão arterial sistêmica e do diabetes mellitus na morbidade e mortalidade de seus portadores, esses indivíduos devem ser identificados, classificados, monitorados e acompanhados. Este estudo se caracteriza como uma forma de acompanhar esses pacientes, otimizando o seu acompanhamento ambulatorial, visando a maximização do cuidado e a redução das complicações inerentes a essas comorbidades por meio da organização do processo de trabalho. As operações propostas para enfrentar o problema foram: diagnóstico, classificação de risco, definição de um protocolo e de um cronograma de acompanhamento. Foi realizada uma revisão bibliográfica para fundamentação teórica da elaboração desses itens. O objetivo desse trabalho é propor uma opção ao modelo atual, por meio da implantação de um arquivo rotativo para atender os pacientes portadores de hipertensão arterial e de diabetes, como estratégia de reorganização do acompanhamento clínico desses grupos de risco.