Objetivo: comparar a acuracia do estudo histopatologico e da reacao em cadeia por polimerase (PCR) no diagnostico da infeccao pelo papilomavirus humano (HPV) em lespes do colo uterino de mulheres infectadas pelo virus da imunodeficiencia humana (HIV). Metodos: foram estudadas 52 mulheres soropositivas para o HIV com lesoes cervicais clinicamente suspeitas de HPV nas quis se realizou raspado ectocervical para a PCR e biopsia dirigida pela ocolposcopia, para o estudo histopatologico. As amostras de tres pacientes se mostraram sem qualidade para a PCR, reduzindo a populacao estudada para 49. Resultados: a prevalencia de hpv foi de 53% pela histopatologia e de 85,7% pela PCR. Denter as 42 pacientes com HPV detectado pela PCR, 26 foram confirmadas pela histopatologia (sensibilidade = 61,9%). Esta, por sua vez, nao demonstrou nenhum resultado falso-positivo (especificidade = 100%), com predicao positiva de 100%. Comparando-se os dois resultados, encontrou-se para a histopatologia: valor preditivo positivo = 100% e valor preditivo negativo = 30,4%. Das 26 pacientes com histopatologia positiva para HPV, 15 (57,6%) apresentaram neoplasias intra-epiteliais cervicais (NIC). O risco relativo de uma paciente com HPV apresentar NIC foi de 13,3. Conclusao: a histopatologia mostrou 100% de acerto para o diagnostico de HPV, o que significa dizer que, quando a biopsia for positiva o HPV certamente estara presente, confirmando a suspeita clinica. No entanto, a baixa sensibilidade retira da histopatologia o valor como exame de rastramento nesse grupo de mulheres.