Este artigo apresenta as perspectivas teorico-metodologicas da avaliacao em saude considerando o contexto politico-decisorio de uma possivel estruturacao governamental por programas e uma gestao por resultados no proximo quinquenio. As principais questoes discutidas se organizam em tres eixos: 1) a necessidade de um modelo teorico orientando o processo de avaliacao; 2) a exigencia de pluralidade metodologica dada a contextualizacao das acoes programaticas a complexidade das medidas de resultados; e 3) a obrigatoriedade de dispositivos institucionais que regulamentem os estudos de avaliacao garantindo a qualidade e utilidade do produto final. Ao final do texto se focaliza a importancia de se fomentar uma pesquisa avaliativa voltada para a construcao de evidencias cientificas em saude publica e suas implicacoes para a formacao de avaliadores.